Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CENPBP07199 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPBP07199 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPBP07199 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPBP07199 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPBP07199 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPBP07199 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPBP07199 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPBP07199 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPBP07199 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPBP07199 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CENPBP07199 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBP07199 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBP07199 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms