Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NEFLP07196 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NEFLP07196 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEFLP07196 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEFLP07196 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEFLP07196 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NEFLP07196 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFLP07196 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms