Protein–RNA interactions for Protein: P04259

KRT6B, Keratin, type II cytoskeletal 6B, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6BP04259 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRT6BP04259 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRT6BP04259 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms