Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOC1P02654 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOC1P02654 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOC1P02654 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms