Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IFNB1P01574 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFNB1P01574 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms