Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SKAP2O75563 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms