Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E2F6O75461 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E2F6O75461 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms