Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EIF5BO60841 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EIF5BO60841 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms