Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIC3O60481 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms