Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYNGR3O43761 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SYNGR3O43761 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms