Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRAF3IP2O43734 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF3IP2O43734 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF3IP2O43734 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF3IP2O43734 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF3IP2O43734 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF3IP2O43734 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF3IP2O43734 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF3IP2O43734 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF3IP2O43734 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF3IP2O43734 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF3IP2O43734 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF3IP2O43734 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRAF3IP2O43734 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms