Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
XRCC2O43543 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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