Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBDO15205 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBDO15205 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBDO15205 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBDO15205 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBDO15205 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBDO15205 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBDO15205 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBDO15205 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBDO15205 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBDO15205 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBDO15205 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBDO15205 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBDO15205 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBDO15205 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBDO15205 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms