Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VILLO15195 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VILLO15195 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VILLO15195 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VILLO15195 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VILLO15195 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VILLO15195 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VILLO15195 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VILLO15195 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VILLO15195 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VILLO15195 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VILLO15195 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VILLO15195 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VILLO15195 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VILLO15195 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VILLO15195 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VILLO15195 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VILLO15195 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VILLO15195 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VILLO15195 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VILLO15195 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VILLO15195 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms