Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PCH4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PCH4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PCH4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PCH4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms