Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGB1P1B2RPK0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms