Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NOTOA8MTQ0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms