Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TVP23AA6NH52 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms