Protein–RNA interactions for Protein: A4QPH2

PI4KAP2, Putative phosphatidylinositol 4-kinase alpha-like protein P2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP2A4QPH2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PI4KAP2A4QPH2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PI4KAP2A4QPH2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms