Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A8Q9Y2E8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC9A8Q9Y2E8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC9A8Q9Y2E8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms