Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AGTPBP1Q9UPW5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AGTPBP1Q9UPW5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AGTPBP1Q9UPW5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AGTPBP1Q9UPW5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.5 ms