Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMKLBQ9ULI2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIMKLBQ9ULI2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMKLBQ9ULI2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMKLBQ9ULI2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms