Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
AMFRQ9UKV5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AMFRQ9UKV5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AMFRQ9UKV5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AMFRQ9UKV5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms