Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ1

LAMP5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP5Q9UJQ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LAMP5Q9UJQ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMP5Q9UJQ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMP5Q9UJQ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms