Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIMS3Q9UJD0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RIMS3Q9UJD0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIMS3Q9UJD0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms