Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms