Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VNN3Q9NY84 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VNN3Q9NY84 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms