Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THUMPD1Q9NXG2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THUMPD1Q9NXG2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms