Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH0

EXD2, Exonuclease 3'-5' domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXD2Q9NVH0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXD2Q9NVH0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXD2Q9NVH0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXD2Q9NVH0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXD2Q9NVH0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms