Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRC4CQ9HCJ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC4CQ9HCJ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC4CQ9HCJ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC4CQ9HCJ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4CQ9HCJ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4CQ9HCJ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4CQ9HCJ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4CQ9HCJ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4CQ9HCJ2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4CQ9HCJ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC4CQ9HCJ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms