Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMURF2Q9HAU4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMURF2Q9HAU4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMURF2Q9HAU4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms