Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
WDR41Q9HAD4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
WDR41Q9HAD4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WDR41Q9HAD4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms