Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
REEP1Q9H902 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
REEP1Q9H902 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REEP1Q9H902 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.8 ms