Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2J2Q9GZM3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2J2Q9GZM3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR2J2Q9GZM3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms