Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCSER1Q9C0I3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCSER1Q9C0I3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CCSER1Q9C0I3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCSER1Q9C0I3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
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