Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SMIM7Q9BQ49 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMIM7Q9BQ49 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SMIM7Q9BQ49 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms