Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RBBP8Q99708 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RBBP8Q99708 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RBBP8Q99708 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms