Protein–RNA interactions for Protein: Q96QP1

ALPK1, Alpha-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK1Q96QP1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALPK1Q96QP1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALPK1Q96QP1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALPK1Q96QP1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms