Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NSMCE2Q96MF7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NSMCE2Q96MF7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NSMCE2Q96MF7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NSMCE2Q96MF7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms