Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHAMP1Q96JM3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHAMP1Q96JM3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHAMP1Q96JM3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHAMP1Q96JM3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms