Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3YL1Q96HL8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3YL1Q96HL8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3YL1Q96HL8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3YL1Q96HL8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3YL1Q96HL8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms