Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2E3Q969T4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2E3Q969T4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE2E3Q969T4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2E3Q969T4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms