Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERCC4Q92889 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC4Q92889 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC4Q92889 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms