Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN4Q92575 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBXN4Q92575 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBXN4Q92575 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms