Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATG4AQ8WYN0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATG4AQ8WYN0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATG4AQ8WYN0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179 ms