Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GNPDA2Q8TDQ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GNPDA2Q8TDQ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GNPDA2Q8TDQ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms