Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ACTRT1Q8TDG2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ACTRT1Q8TDG2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACTRT1Q8TDG2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACTRT1Q8TDG2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.4 ms