Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAA9

VANGL1, Vang-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL1Q8TAA9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VANGL1Q8TAA9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VANGL1Q8TAA9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VANGL1Q8TAA9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VANGL1Q8TAA9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VANGL1Q8TAA9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VANGL1Q8TAA9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VANGL1Q8TAA9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VANGL1Q8TAA9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VANGL1Q8TAA9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VANGL1Q8TAA9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VANGL1Q8TAA9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VANGL1Q8TAA9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VANGL1Q8TAA9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms