Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SVIPQ8NHG7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SVIPQ8NHG7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SVIPQ8NHG7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms