Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC148Q8NFR7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC148Q8NFR7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC148Q8NFR7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC148Q8NFR7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms